主衛浴的出現雖然方便了主人也有較好的私密性，但相對來說也帶來了不少風水問題。
總的來說衛生間的地面不能高於臥室的地面，浴缸也不能有一種高高在上的感覺——比如近年來非常流行的將浴缸嵌入高高盆臺內的模式，雖然漂亮，但容易引發問題：五行學說認為，水是向下流的，屬潤下格，長期住在被水滋潤的臥室裡，容易發生內分泌系統的疾病。如果您非常喜歡這樣的嵌入式浴盆，可以將它安置在另一間離開臥室較遠的衛生間內。
若房屋在設計時已經將衛生間置於中央，千萬記得要掛上門簾，同時在衛生間裡擺放一杯不加蓋的粗鹽，或擺放活化氣場的物品，如綠色植物。
同時衛生間裡應時刻保持乾淨整潔。
不過最頭疼的莫過於雙衛戶型中主衛浴的門不可避免地對著臥室，並且大多對著臥室裡的床位。
若是這種情況，那你最好就要考慮調整門或者床的位置，或者在衛生間門外掛個竹簾或者水晶簾擋擋煞氣。