鼠麴草顯微鑑別：葉表面觀：上下表皮密被白色絨毛。非腺毛細線狀長1-2mm，由基細胞和頂細胞組成，基細胞2-4個，單列，寬8-12μm，頂細胞窄而細長，為單個細胞，常扭曲，交織成團。腺毛常散在非腺毛間，腺柄較短，為單細胞，腺頭卵圓形，由5-10個細胞組成，內含黃棕色油狀物。
鼠麴草理化鑑別：取本品粗粉2g，加甲醇30ml，煮沸5min，濾過。取濾液2ml，加濃鹽酸數滴，再加鎂粉少量，深液變為粉紅色。另取小ml，加1%三氯化鋁甲醇液數滴，溶液顯色。(檢查黃酮)。薄層色譜①取本品粗粉10g，加70%乙醇100ml迴流提取4h，濾過。濾液濃縮至幹，加熱水深解，濾地。濾液用乙酸乙酯提取5次，乙酸乙酯液用無水硫酸鈉脫水，濾過。濾液濃縮作供試液，另取槲皮素、山柰酚為對照品。分別點樣於矽膠G-0.7%CMC板上，用苯-甲醇-乙酸(35：5：5)展開，2%三氯化鋁噴霧，紫外光燈(254nm)下觀察熒光，槲皮素為黃綠色，山柰酚為淡藍色。取樣品粗粉10g，加蒸餾水200ml，在沸水浴加熱提取2h，濾過。濾液用2mol/L鹽酸酸化，酸化液用乙醚提取4次，合併醚液，濃縮，供點樣用。對照品：延胡索酸、苯甲酸、氯原酸(分別用無水乙醇溶解)。分別點樣於矽膠G-CMC板上，用苯-甲醇-水(79：20：7)展開。0.1%溴酚藍乙醇液噴霧，供試品色譜中在與對照品色譜相應益處顯相同顏色的斑點。
鼠麴草性狀鑑別：全草密被灰白色綿毛。根紋細，灰桂冠以。莖常自基部分枝成叢，長15-30cm，直徑1-2mm。葉皺縮捲曲，展平後葉片呈條狀匙形或倒披針形，長2-6cm，寬0.3-1cm，全緣，兩面均密被灰白色綿毛;質柔軟，頭狀花序頂生，多數，金黃色或棕黃色，舌狀花及管狀花多已落脫，花托扁平，有花脫落後的痕跡。氣微，味微甘。
以色灰白、葉及花多者為佳。