不同的禽流感病毒症狀表現各不相同，可以表現為呼吸道症狀、結膜炎、甚至死亡。H7病毒的大部分感染和家禽中暴發的流感有關，現有資料來看，H7N2、H7N3毒力較弱。
但是，H7N9與H5N1有諸多相似之處。從現有的臨床表現來看，H7N9部分病例病情比較重，臨床表現、病情程度和H5N1相同。不過，H5N1在禽類中具有高致病性的特徵，禽類感染了H5N1病毒後，就會發病，出現明顯病症，知道哪裡有動物發病，就可以馬上進行撲滅。但H7N9對禽類是低致病性，感染了H7N9的禽類，沒有發病，或者病症很輕。這也是H7N9疫情防範的最大難點。
根據流感的潛伏期及現有H7N9禽流感病毒感染病例的調查結果，潛伏期一般為7天以內。國家食品安全風險評估中心專家提醒，禽流感病毒在較低溫度糞便中可存活1周，在4℃水中可存活1個月。
一般情況下，H7N9的臨床表現包括以下幾個方面：
一、一般表現
患者一般表現為流感樣症狀，如發熱，咳嗽，少痰，可伴有頭痛、肌肉痠痛和全身不適。重症患者病情發展迅速，表現為重症肺炎，體溫大多持續在39℃以上，出現呼吸困難，可伴有咯血痰;可快速進展出現急性呼吸窘迫綜合徵、縱隔氣腫、膿毒症、休克、意識障礙及急性腎損傷等。
二、實驗室檢查指標有：
1、 血常規。白血球總數一般不高或降低。重症患者多有白血球總數及淋巴細胞減少，並有血小板降低。
2、 血生化檢查。多有肌酸激酶、乳酸脫氫酶、天門冬氨酸氨基轉移酶、丙氨酸氨基轉移酶升高，C反應蛋白升高，肌紅蛋白可升高。
3、 核酸檢測。對患者呼吸道標本(如鼻咽分泌物、口腔含漱液、氣管吸出物或呼吸道上皮細胞)採用real time PCR(或RT-PCR)檢測到H7N9禽流感病毒核酸。
4、 病毒分離。從患者呼吸道標本中分離H7N9禽流感病毒。
5、 胸部影像學檢查。發生肺炎的患者肺內出現片狀影像。重症患者病變進展迅速，呈雙肺多發磨玻璃影及肺實變影像，可合併少量胸腔積液。發生ARDS時，病變分佈廣泛。