公寓房的水電費等是按照商業標準收取；一般可利用的面積較小，居住舒適度不如住宅房；產權年限是40年或50年，且不能自動續期；首付比例和貸款利率一般偏高。公寓房的缺點具體如下：
1、水電費高
公寓房一般建造在經營性質的土地上，屬於商用性質，其水費、電費、物業費等是按照商業標準收取的，支出成本更高。而且很多公寓房為了確保居住安全，是不可以在室內安裝煤氣的。
2、房屋面積小
一般來說，公寓房是小戶型房屋，整體可以利用的面積比較小。對於居住人數比較多的購買者來說，購買公寓房居住會比較擁擠，居住舒適度不如住宅房。
3、產權年限短
公寓房的產權年限一般只有40年或者50年，相比於70年產權的住宅房，其產權年限明顯少了不少。而且產權年限到期後，不能像70年產權房一樣自動續期，需要主動申請續期，其續期行為還可能會被駁回，續期申請通過後還需要繳納一定的土地出讓金。
4、首付比例和貸款比例高
公寓房的首付比例和貸款利率一般偏高，其首付一般要支付房屋價格的5成，貸款按照商用貸款利率進行，比住宅房的首付和貸款利率更高。