鴉膽子有毒，對胃腸道及肝腎均有損害，內服需嚴格控制劑量，不宜多用久服。外用注意用膠布保護好周圍正常面板，以防止對正常面板的刺激。
孕婦及小兒慎用。胃腸出血及肝腎病患者，應忌用或慎用。
不良反應：鴉膽子殼及種子均有毒，臨床的毒性反應發生率較高。其毒性成分主要存在於水溶性的苦味成分中，為劇烈的細胞原漿毒，對中樞神經有抑制作用，對肝腎實質有損害作用，並能使內臟動脈顯著擴張，引起出血。其揮發油對面板和粘膜有強烈的刺激性。據臨床報道，成人服12粒即有中毒危險。中毒時主要表現為噁心，嘔吐，食慾不振，頭昏，乏力，腹痛，便血，胃腸道充血，尿量減少，體溫增高，眼結膜充血，四肢麻木或癱瘓，昏迷，抽搐等。區域性應用對面板和粘膜有強烈的刺激性，個別人發生過敏反應。鴉膽子中毒的主要原因：一是用量過大;二是口服時直接吞服或嚼服。因此，應用鴉膽子必須嚴格掌握好用量，且按正確方法服用，以保證用藥安全。中毒救治的一般療法為：早期催吐、洗胃，口服牛奶或蛋清，酌用瀉藥;靜脈點滴葡萄糖、鹽水及注射維生素;在昏睡、呼吸困難時，酌情給予中樞興奮劑，必要時可行人工呼吸。