對中樞神經系統的作用
石菖蒲有鎮靜作用。煎劑或揮發油均能使小鼠自發活動減少， 解除單籠飼養小鼠的攻擊行為;亦能延長戊巴比妥鈉所致的睡眠時間，對閾下催眠劑量的戊巴比妥鈉有協同作用。此外， 尚能顯著延長戊巴比妥鈉的麻醉時間。研究表明：揮發油中的細辛醚是鎮靜的有效成分，但除去揮發油後仍有鎮靜作用， 提示其鎮靜成分不只一種。
石菖蒲煎劑對戊四氮引起的小鼠驚厥有一定的對抗作用，與對照組相比， 能使自主活動減少，抽搐開始時間推遲， 抽搐鼠數較少。揮發油中的α-細辛醚140mg/kg能完全對抗小鼠電驚厥和戊四氮驚厥，並能對抗家兔側腦室給Ach所致驚厥，除去揮發油的水煎劑亦有作用。
對消化系統的作用
石菖蒲煎劑內服能促進消化液的分泌及制止胃腸異常發酵，並有緩解腸管平滑肌痙攣的作用。石菖蒲中含的細辛醚能對抗氯化鋇引起的離體腸管的興奮作用。
抗真菌作用
菖蒲水浸劑(1：3)， 在試管內對堇色毛癬菌、同心性毛癬菌、許蘭黃癬菌、奧杜盎小芽胞癬菌、鐵鏽色小芽胞癬菌、羊毛狀小芽胞癬菌、腹股溝表批癬菌、紅色表皮癬菌、考夫曼-沃爾夫表皮癬菌、星形奴卡菌等面板真菌均有不同程度的抑制作用。
其他作用
石菖蒲中所含的α-細辛醚有平喘作用，能對抗組胺引起的支氣管收縮， 並有鎮咳作用。臨床上對支氣管哮喘患者的肺通氣功能有改善作用。