特殊的結構特點和顏色變化極為豐富，這使它與別的玉石較容易區分。不過某些顏色的品種有時與其它玉石相似。
半透明藍綠色獨山玉與高品質的翡翠外觀相近，但是翡翠為纖維交織結構與獨山玉的粒狀結構明顯不同，通過折射率值、密度值測試很容易將二者區分。而且此種獨玉顏色因含鉻雲母所致，在查爾斯濾色鏡下變紅，另外，獨山玉綠色偏藍，常夾有暗色礦物的黑點，這些特徵與相似的翡翠亦明顯有別。
白獨玉易與外觀相似的石英質玉石和軟玉中的白玉相混淆，白玉的結構是氈狀結構，非常細膩，光澤一般為玻璃-油脂光澤，這些和獨山玉很容易區分，石英質玉石雖然也是粒狀結構，但它的折射率和比重都明顯低於獨山玉，所以也很好區分。