咖啡雖然味苦，但是卻具特異的香味，含咖啡醇和咖啡因生物鹼，有刺激中樞神經，促進肝糖元分解，升高血糖的功能。是麻醉、利尿、興奮和強心藥物，適量飲用可使人暫時精力旺盛，思維敏捷。焙炒過的咖啡還有幫助消化的功效。
目前，已知道咖啡對人的好處有：
1、咖啡可以刺激腸胃激素或蠕動激素，促進代謝機能，活絡消化器官，對便祕有很大功效。
2、咖啡可以消除疲勞，咖啡所含的咖啡因有刺激腦部中樞神經系統的作用，因此可以延長腦部的清醒時間，使思路清晰、敏銳，且注意力較為集中，可提高工作及學習的效率，還可以使人精神振奮，心情愉快，紓解憂鬱的現象。
3、咖啡有解酒的功能，咖啡能將由酒精轉變而來的乙醛快速氧化，所以酒後喝咖啡能夠解酒。
4、咖啡可利尿、預防膽結石，咖啡所含的咖啡因能促進腎臟機能，有利尿作用，幫助體內將多餘的鈉離子排出體外。咖啡因還能刺激膽囊收縮，並減少膽汁內容易形成膽結石的膽固醇。
5、咖啡有抗氧化的效果：咖啡中含有豐富的咖啡因、咖啡酸、綠原酸等成份，可以有效抵抗體內的自由基。
6、咖啡有保護心臟血管的功能：咖啡富含多酚化合物，這種物質能延緩低密度脂蛋白的氧化時間和溶解血液凝塊及阻止血栓的形成;咖啡還能增強血管收縮，進血液迴圈，避免血管擴強而頭痛。所以，咖啡可以預防心血管疾病的作用。
7、咖啡最早被人認識的一個功能是止痛：咖啡因做為一個藥品時，可以加強某些止痛劑的效果。
此外，咖啡還可以防止放射線的傷害。由此可見，咖啡對人體還是具有很好的作用的，但是咖啡不能空腹飲用，可不能過量，過量容易導致咖啡因中毒，同時咖啡因還會使人上癮。